Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RtcbQ99LF4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RtcbQ99LF4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms