Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM209Q96SK2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM209Q96SK2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM209Q96SK2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM209Q96SK2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM209Q96SK2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM209Q96SK2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM209Q96SK2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM209Q96SK2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms