Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med28Q920D3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms