Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q91WD4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q91WD4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q91WD4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q91WD4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q91WD4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q91WD4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q91WD4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q91WD4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q91WD4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Q91WD4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q91WD4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q91WD4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q91WD4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q91WD4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q91WD4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms