Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc3Q91W40 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms