Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d2Q8VD57 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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