Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Glis1Q8K1M4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Glis1Q8K1M4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms