Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem17Q8K0U3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem17Q8K0U3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms