Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE0

Serpina11, Serpin A11, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina11Q8CIE0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Serpina11Q8CIE0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina11Q8CIE0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms