Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg4aQ8C9S8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4aQ8C9S8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms