Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l1Q8C0J2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l1Q8C0J2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l1Q8C0J2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l1Q8C0J2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l1Q8C0J2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l1Q8C0J2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg16l1Q8C0J2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l1Q8C0J2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms