Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube3dQ8BX13 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube3dQ8BX13 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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