Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Usp54Q8BL06 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp54Q8BL06 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms