Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zcchc4Q8BKW4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms