Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdca8Q8BHX3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca8Q8BHX3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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