Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Vipas39Q8BGQ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Vipas39Q8BGQ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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Vipas39Q8BGQ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Vipas39Q8BGQ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Vipas39Q8BGQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Vipas39Q8BGQ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Vipas39Q8BGQ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Vipas39Q8BGQ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vipas39Q8BGQ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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