Protein–RNA interactions for Protein: Q80U12

Sgsm2, Small G protein signaling modulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm2Q80U12 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgsm2Q80U12 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgsm2Q80U12 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms