Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pja2Q80U04 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms