Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppp6r1Q7TSI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp6r1Q7TSI3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms