Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1bQ7TSF1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms