Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ckap2lQ7TS74 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ckap2lQ7TS74 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms