Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sys1Q78S06 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sys1Q78S06 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms