Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd3eapQ76KJ5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eapQ76KJ5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms