Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rph3alQ768S4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms