Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPGS1Q6ZTW0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms