Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ino80Q6ZPV2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ino80Q6ZPV2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms