Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC174Q6PII3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms