Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc82Q6PG04 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc82Q6PG04 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc82Q6PG04 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms