Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrimpolQ6P1E7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrimpolQ6P1E7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrimpolQ6P1E7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrimpolQ6P1E7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms