Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pprc1Q6NZN1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pprc1Q6NZN1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pprc1Q6NZN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pprc1Q6NZN1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pprc1Q6NZN1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pprc1Q6NZN1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pprc1Q6NZN1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pprc1Q6NZN1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pprc1Q6NZN1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms