Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac4Q6NZM9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hdac4Q6NZM9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac4Q6NZM9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms