Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23ipQ6NZC7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec23ipQ6NZC7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms