Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpsf6Q6NVF9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms