Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2cQ6NVE3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2cQ6NVE3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms