Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
B4galnt3Q6L8S8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
B4galnt3Q6L8S8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms