Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms