Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CltcQ68FD5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CltcQ68FD5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms