Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vil1Q62468 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms