Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phox2aQ62066 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms