Protein–RNA interactions for Protein: Q61967

Zfp90, Zinc finger protein 90, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp90Q61967 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp90Q61967 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp90Q61967 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp90Q61967 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms