Protein–RNA interactions for Protein: Q61923

Kcna6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna6Q61923 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcna6Q61923 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcna6Q61923 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcna6Q61923 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 352.6 ms