Protein–RNA interactions for Protein: Q61575

Foxn1, Forkhead box protein N1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn1Q61575 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn1Q61575 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn1Q61575 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxn1Q61575 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxn1Q61575 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms