Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfap2bQ61313 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2bQ61313 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms