Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms