Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms