Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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