Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rtl5Q5DTT4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtl5Q5DTT4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms