Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxn3Q499D0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxn3Q499D0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxn3Q499D0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxn3Q499D0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Foxn3Q499D0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxn3Q499D0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxn3Q499D0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxn3Q499D0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxn3Q499D0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms