Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cfap65Q3V0B4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cfap65Q3V0B4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cfap65Q3V0B4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cfap65Q3V0B4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cfap65Q3V0B4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cfap65Q3V0B4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cfap65Q3V0B4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap65Q3V0B4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfap65Q3V0B4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms