Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc190Q3URK1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc190Q3URK1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms